Valtio omistaa koko VR-konsernin emoyhtiön VR-Yhtymä Oy:n osakekannan. Omistajaa edustaa
valtioneuvoston kanslian omistajaohjausyksikkö, joka myös käyttää päätösvaltaa VR-Yhtymän yhtiökokouksessa.
Yhtiökokous nimittää VR-Yhtymän
hallituksen ja
hallintoneuvoston jäsenet, jotka päättävät yhtiön strategisista linjauksista. Valtio edellyttää, että valtionyhtiö toimii kannattavasti ja tekee voitollisen tuloksen.